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Equipe

O LAFIECO mantém uma equipe que varia entre 10 a 15 membros, com pós-doutorandos, doutorando, mestrandos e alunos de iniciação científica. São desenvolvidos diversos projetos em diferentes níveis.

Amanda Rusiska Piovezani

Doutoranda

http://lattes.cnpq.br/7819202594528611
arpiovezani@usp.br
30918756

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual do Norte do Paraná (2009), mestrado em Bioinformática pela Universidade de São Paulo (2013) e doutorado corrente em Bioinformática pela Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Genética com ênfase em Bioinformática, atuando principalmente nos temas: análise de sequências biológicas, predição de alvos de microRNAs. 

Arthur Cambler

Estagiário/aluno de Iniciação Científica

http://lattes.cnpq.br/4557344602147079
arthurbcambler@gmail.com
(11) 3091-8756

Graduado em Biologia pelo Instituto de Biociências da USP, fez o projeto de Iniciação Científica sobre o fracionamento da parede celular de cana-de-açúcar. Esse projeto despertou seu interesse pela parede celular, que agora é seu objeto de estudo.


Projeto: Estudo para a redução do processo de fracionamento da parede celular de cana-de-açúcar

O fracionamento da parede celular da cana-de-açúcar é um processo lento e dispendioso, tanto para procedimentos laboratoriais como industriais. Isso se dá devido à intrincada estrutura da parede celular que dificulta o acesso aos açúcares nela presentes. O projeto teve como objetivo encontrar um método mais curto, mas igualmente eficiente, de realizar o fracionamento em laboratório, para isso removendo algumas das etapas já existentes do fracionamento e fazendo diferentes combinações entre elas.

Bruno Flausino

Aluno de doutorado

http://lattes.cnpq.br/8709929899963626
brunoflausino@hotmail.com
(011) 30918756

Possui graduação em Licenciatura em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Campinas (2010). Durante a graduação fez iniciação científica pelo Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, pelo Instituto de Química (Unicamp) e pelo Departamento de Biologia Vegetal (Unicamp). É mestre em genética pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2012). Atualmente é doutorando pelo programa “Internacional Biologia Celular e Molecular Vegetal” pela Universidade de São Paulo.

 

Projeto: Papel do glucano de ligação mista na formação do aerênquima em raízes de plântulas de Sorghum bicolor

 

O glucano de ligação mista (GLM) é o polissacarídeo que possui maior variação na degradação do seu conteúdo durante a formação do aerênquima em cana-de-açúcar. Em sorgo, verificaremos se esse mesmo padrão de degradação do GLM se mantém. Para isso faremos imunolocalização desse polissacarídeo (GLM) ao longo das raízes de plântulas de sorgo, local em que já encontramos o desenvolvimento do aerênquima através de prévia caracterização anatômica por cortes histológicos. Devido ao importante papel do GLM no desenvolvimento do aerênquima em raízes, encontramos os genes que codificam para as sintases e hidrolases do GLM através inferências filogenéticas. Verificamos o padrão de expressão desses genes em diversos tecidos por RT-qPCR. O projeto visa também imunolocalização dessas hidrolases e sintases específicas do GLM e análises transcritômicas por RNA-seq de diferentes segmentos das raízes de sorgo. De posse dos genes mais importantes do ponto de vista biotecnológico e do desenvolvimento do aerênquima, obteremos linhagens transgênicas de sorgo cujos fenótipos serão posteriormente caracterizados.

Bruno Viana Navarro

Aluno de Doutorado

http://lattes.cnpq.br/4978751226820421
bruno_vnavarro@usp.br
(11)30918062

Possui graduação em Bacharelado em Ciências Biológicas - Biotecnologia pela Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF) e em Licenciatura em Ciências da Natureza - Física pelo Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia Fluminense (IF-Fluminense) . Desenvolveu estágio de Iniciação Científica no Laboratório de Biologia Celular e Tecidual, na área de cultura de tecidos vegetais com ênfase em Fisiologia do desenvolvimento vegetal e Morfogênese in vitro.Atualmente é aluno de Doutorado-direto pelo Programa de Interunidades em Biotecnologia, na Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Biotecnologia Vegetal, com ênfase em Biologia Celular e Fisiologia do Desenvolvimento Vegetal, atuando principalmente nos seguintes temas: embriogênese, fisiologia, bioquímica e sinalização do desenvolvimento, morfogênese in vitro e metabolismo de carboidratos.

 

Projeto: Marcadores bioquímicos associados ao metabolismo de carboidratos durante a embriogênese zigótica e somática de Araucaria angustifolia

 

Araucaria angustifolia é uma conífera subtropical nativa do Brasil que apresenta sementes recalcitrantes, e devido a sua importância econômica, tem sido intensamente explorada ao longo dos anos, encontrando-se atualmente classificada como espécie em perigo crítico de extinção. O sistema A. angustifolia tem sido utilizado em estudos fisiológicos, bioquímicos e moleculares, numa abordagem integrativa da embriogênese zigótica e somática. Estas pesquisas tem abordado a importância e participação de diferentes sinalizadores, com destaque para os reguladores de crescimento e diferenciação, ao longo dos processos de embriogênese. Recentemente, abordagens moleculares como transcriptoma e proteoma permitiram a identificação de possíveis marcadores moleculares na embriogênese, e a sua correlação com os processos biológicos capazes de modular este processo in vitro no sistemaA. angustifolia. Neste contexto foi destacada a importância do estudo dos carboidratos como sinalizador e a sua relação com outros sinalizadores durante o processo de embriogênese neste sistema vegetal. Assim, o presente trabalho tem como objetivo investigar a participação dos carboidratos e a sua interação com as redes de sinalização de etileno, óxido nítrico (ON) e espécies reativas de oxigênio (EROs) nos processos de embriogênese zigótica e somática de A. angustifolia.

 

Carmen E. Palacios Jara

Aluna de Doutorado

http://lattes.cnpq.br/9403104487456834
cpalacios@usp.br
(11) 30917532

Bióloga formada pela Universidad Nacional Agraria La Molina (Lima - Perú) (2003) e Mestre em Ciências pelo Departamento de Botânica, do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, na área de Recursos Econômicos Vegetais (2012). Desenvolve projetos em mudanças climáticas e plantas alimentícias focado a determinar substâncias procedentes do metabolismo primário e secundário Têm experiência na avaliação de carboidratos, lipídeos, substâncias fenólicas e ceras vegetais.



Area de atuação: Botânica econômica e Fitoquímica



Projeto: Substâncias fenólicas de sorgo (Sorghum bicolor (L.) Moench) cultivado sob estresse hídrico e atmosfera enriquecida de gás carbônico



As evidências de que ocorrerão mudanças climáticas globais, em função do aumento da concentração de gases de efeito estufa decorrentes de atividades antrópicas, têm se apresentado cada vez mais consistentes. Em consequência, não se sabe como a síntese de metabólitos secundários seria afetada sob condições de enriquecimento de CO2, nem sob a possíveis alterações nos padrões de chuvas, e tampouco sob a condição de acoplamento dos dois parâmetros climáticos. O presente projeto prevê avaliar plantas de sorgo da variedade BRS 330 em uso comercial no Brasil, em câmaras de topo aberto (OTCs). Nas plantas em crescimento, serão analisados substâncias provenientes do metabolismo secundário. Principais substâncias como, fenilpropanoides, flavonoides, taninos e ligninas, serão avaliados na planta toda de forma integrada. As análises de fenilpropanoides e flavonoides serão determinadas por CLAE-DAD-ESI/EM e ligninas por CG/EM.

Débora Pagliuso

Aluna de Mestrado

http://lattes.cnpq.br/0500454673324614
deborapagliuso@usp.br
(11) 3091-7592

Título do projeto: “Caracterização comparativa das paredes celulares de lentilhas d´água (Lemnaceae)”.

 

Lentilhas d’água são as menores plantas aquáticas flutuantes com capacidade de florir. As plantas dessa família foram classificadas em cinco gêneros: Spirodela, Landoltia, Lemna, Wolffia e Wolffiella e podem ser encontradas mundialmente devido sua capacidade adaptativa e crescimento rápido. Esse último implica no acúmulo acelerado de carboidratos e proteínas, o que acaba conferindo um enorme potencial biotecnológico (bioenergético, farmacêutico, alimentício, remediação de águas, testes de toxidade, ciclagem de carbono e como sistema modelo de estudos). Suas aplicações podem ser ampliadas com o estudo direcionado de paredes celulares, pois os carboidratos são conservados durante a linhagem evolutiva. Sendo assim a construção de um modelo de parede permitirá compreender a fisiologia, redesenhar plantas, ter modelos de cultivares para aquicultura caracterizada, e informações de processos evolucionários. Portanto, o objetivo desse projeto é comparar as paredes celulares de Landoltia punctata, Lemna gibba L., Wolffia borealis e Wolffiella caudata e caracterizar profundamente a espécie modelo Spirodela polyrhiza e correlacioná-lo com seu mapa genômico.

 

Palavras chave: lentilhas d’água, parede celular, carboidratos, biotecnologia 

 

Possui graduação em Biotecnologia pela Pontifícia Universidade Católica do Paraná (2015). Tem experiência na área de fitorremediação com metais pesados, biologia molecular e cultura de tecidos, atuando com análise bioquímica de paredes celulares. 

Eglee Silvia Gonçalves Igarashi

Técnica

http://lattes.cnpq.br/1673813612717986
e.igarashi_usp@yahoo.com.br
(11) 3091-7592

Formada em Ciências Biológicas pela Unesp São Vicente, habilitada em Gerenciamento Costeiro, em Dezembro de 2008. Técnica-Bolsista pela USP em Abril de 2009. Técnica do Laborátório de Fisiologia Vegetal da USP desde junho de 2010, responsável pelas análises de carboidratos em HPLC do Grupo de Pesquisa, atuando também na área de Gerenciamento de Laboratórios e administração de projetos.

Eveline Queiroz de Pinho Tavares

Pós-Doutoranda

http://lattes.cnpq.br/5290284733997318
evelinetavares@usp.br
(11) 3091-7592

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade de Brasília (2007), mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular) pela Universidade de Brasília (2010) e Doutorado em Botânica sub-área Biologia de Sistemas pela Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Bioquímica, com ênfase em Biologia Molecular, atuando principalmente nos seguintes temas: cana de açúcar, etanol de segunda geração, aerênquima, parede celular e bioetanol. Finalizou o Doutorado na Universidade de São Paulo junto ao grupo de Fisiologia Ecológica de Plantas, com foco em degradação de parede celular em raízes de cana de açúcar durante a formação de aerênquima. Realizou doutorado sanduíche junto à Universidade Paul Sabatier (Toulouse, França) visando a caracterização funcional de reguladores da degradação de parede celular. Atualmente é pós-doutorada no Laboratório de Fisiologia Ecológica de plantas, onde trabalha com análise de transcriptomas de microRNAs relacionados à regulação de glicosil hidrolases de cana-de-açúcar. 

Projeto:  Microtranscriptoma de raízes de cana-de-açúcar durante a formação de aerênquima lisígeno

O presente plano de atividades terá como foco a análise transcricional do fenômeno de formação de aerênquima em cana-de-açúcar. Neste processo a parede celular é atacada de forma precisa, ativando elementos chave da hidrólise de polissacarídeos estruturais.A identificação destes elementos chave de modificação de parede celular são de fundamental interesse da pesquisa em Bioenergia. O sequenciamento de microRNAs pela plataforma IonProton e análise em MirDeep2/Galaxy têm possibilitado a identificação de putativos alvos para melhoramento de plantas.

Flaviane Lopes Ferreira

Aluna de Mestrado

http://lattes.cnpq.br/1551268263930533
flalopesferreira@hotmail.com
(011) 30918756

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Metodista de São Paulo (2014). De 2013 a 2014 fez graduação sanduíche na Loyola University Chicago, EUA pelo Programa Ciências sem Fronteiras. Atualmente, é mestranda na Pós-Graduação em Botânica pela Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Microbiologia e Botânica, com ênfase em cana-de-açúcar, parede celular e bioetanol de segunda geração.

 

Projeto: O papel do fator de transcrição ScRAV1 na expressão de genes de parede celular em cana-de-açúcar.

 

O trabalho tem como objetivo caracterizar o papel do RAV1 na regulação transcricional subjacente à formação do aerênquima lisígeno em raízes de cana-de-açúcar.

Grayce Hellen Romim Silva

Aluna de Mestrado

http://lattes.cnpq.br/8514197934920154
grayce_hellen@hotmail.com
(11) 3091-8756

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Nove de Julho (2013). Atualmente é aluna de mestrado na Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Bioquímica, com ênfase em Biologia Molecular; atuando nos seguintes temas: cana de açúcar, etanol de segunda geração, aerênquima, parede celular, bioetanol, plasmodesmo, glicosil hidrolase.

 

Projeto: O papel da hidrolase de calose (GH 17) na formação do aerênquima da cana-de-açúcar

 

Em busca de compreender os mecanismos que ocorrem na parede celular, estudar a formação do aerênquima em raiz de cana-de-açúcar nos auxilia a tentar entender como as modificações são discorridas, como ocorrem às sinalizações para que algumas células entrem em morte celular programada e aja ação de hidrolases na parede celular, permitindo a formação do aerênquima, mas, em células adjacentes a estas não o fazem. Visando isso, compreender o papel da hidrolase que supostamente possam regular a degradação de calose (um potencial regulador da abertura do plasmodesmo que pode reduzir ou bloquear o trafego citoplasmático), é o objetivo do projeto; analisar a diversidade homeóloga da GH17 (glicosil hidrolase) e sua distribuição no tecido e a ocorrência de calose em raiz de cana-de-açúcar com formação de aerênquima.

Marcos Silveira Buckeridge

Professor

http://lattes.cnpq.br/9650392075455314
msbuck@usp.br
(11) 3091-7592

Marcos Buckeridge é um pesquisador que trabalhou por 20 anos, com espécies nativas neotropicais, no Instituto de Botânica de São Paulo. Durante seu mestrado e doutorado, ele estudou polissacarídeos de parede celular de plantas e em 1995 estabeleceu uma linha de pesquisa centrada na compreensão dos mecanismos fisiológicos e celulares envolvidos no estabelecimento de plântulas de biomas tropicais, bem como o desenvolvimento de ferramentas biotecnológicas para ajudar no uso sustentável da biodiversidade. Mais de 80 publicações foram produzidas nesse período. Com a crescente importância do impacto mundial das alterações climáticas globais, o Dr. Buckeridge tornou-se pioneiro em estudos que tentam compreender como a floresta, incluindo espécies atlânticas e amazônicas, está respondendo com relação à crescente concentração de dióxido de carbono na atmosfera. Mais recentemente, seu grupo de pesquisa iniciou outro foco, visando entender como a cana de açúcar vai responder às alterações climáticas. A relevância desse estudo reside no fato da cana ser atualmente uma das mais importantes culturas no Brasil, sendo responsável pela produção de etanol como combustível. Dr. Buckeridge transferiu-se para a Universidade de São Paulo em 2006 e desde 2009 atua como diretor científico do Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, CTBE, em Campinas. Ele é também coordenador do Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (INCT do Bioetanol.) Foi Presidente da Sociedade Botânica de São Paulo entre 2001 e 2005 e é um dos autores líderes do próximo relatório do Painel Intergovernamental de Mudanças Climáticas (IPCC), a ser apresentado em 2014. Atualmente, Dr. Buckeridge é membro de corpo editorial dos periódicos: Trees:structure and function (Springer), Bioenergy Research (Springer), Global Change Biology Bioenergy e Australian Journal of Botany.

Mariana Brolezzi G. Latarullo

Aluna de Doutorado

http://lattes.cnpq.br/3265428003683567
mbrolezzi@usp.br
(11)3091-7349

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade de Guarulhos (2008) e mestrado em Biotecnologia pela Universidade de São Paulo (2014). Atualmente é doutoranda em Biotecnologia pela Universidade de São Paulo orientada pelo Prof. Dr. Gabriel Padilla e co-orientada pelo prof. Dr. Marcos Buckeridge. Atua na área de enzimologia direcionada para a produção de Etanol de segunda geração.


Projeto: Expressão heteróloga e caracterização de Endopoligalacturonases de origem fúngica (Aspergillus niger), vegetal (Saccharum officinarum) e bacteriana (Bacillus subtilis).

Vinicius Jardim Carvalho

Inic. Científica

http://lattes.cnpq.br/3147635668308826
viniciusjcarvalho@hotmail.com
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Resumo do projeto: Compreender como os diferentes processos nos diferentes níveis organizacionais se relacionam e ainda ter em vista a realização de novos projetos a fim de ter uma compreensão mais ampla das respostas da cana-de-açúcar ao aumento de CO2 e déficit hídrico. Uma abordagem recente que abrange o estudo desses diferentes níveis e permite que enxerguemos um organismo como módulos interagindo e formando um todo complexo é a Biologia de Sistemas. Dentro desta visão, a teoria de redes se destaca por permitir a visualização das relações entre os mais variados fatores, sendo utilizada não só na biologia. Essa teoria é baseada em grafos que são elementos matemáticos. Assim espera-se compreender quais são os principais fatores reguladores e como eles interagem com todo o sistema nas situações fisiológicas propostas.

Viviane Lopes da Costa

Técnica

http://lattes.cnpq.br/9231133963640462
vivianelcosta@yahoo.com.br
30918756

Bióloga, com Mestrado e Doutorado em Botânica pelo Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo. Durante a graduação e a pós-graduação, trabalhou com crescimento, desenvolvimento e genética de algas marinhas vermelhas, obtendo experiência em cultivo sob condições ambientais controladas e técnicas de microscopia. 

 

Técnica de Laboratório no LAFIECO desde junho de 2010, auxilia no desenho experimental, implementação  e organização de cultivos e coletas de plantas, realizados nas dependências do laboratório. Tem experiência especialmente no cultivo de gramíneas como cana-de-açúcar, sorgo, Setaria viridisBrachypodium distachyon e Melinis repens (Rhynchelytrum repens). Além disso, tem experiência em germinação de sementes e crescimento de plântulas e mudas de leguminosas como jatobá, soja e outras árvores nativas, em condições controladas de cultivo, tais como alteração de regime hídrico, disponibilidade de nutrientes ou concentrações aumentadas de gás carbônico na atmosfera.  

 

Auxilia na parte experimental do laboratório, tendo experiência com protocolos de extração e dosagem de amido, fracionamento de parede celular, e protocolos de fixação e preparação de amostras para microscopia.  Gerencia o uso dos equipamentos de secagem de amostras do LAFIECO, bem como o uso do Estereomicroscópio motorizado LEICA M205 A, equipado com fluorescência e capaz de realizar imagens estáticas completamente em foco mesmo para amostras tridimensionais, vídeos, ou imagens lapso de tempo.

 

Além disso, é responsável pela inclusão e atualização das informações neste site.  


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